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一场惊心动魄的战斗结束后，Gatchaman=健、Tekkaman=城二、Polimar=武士、卡辛=铁也四人终于回到自己原本的世界。然而，命运再次将他们带到了一个全新的世界，这里正遭受着名为“恶魔党”的人类之敌的威胁。为了对抗这个强大的敌人，他们重新组成了“科学忍者队”，继续战斗的征程。
然而，在他们对于这个世界感到陌生和违和感的时候，科学忍者队的创设者南部博士却显露出了可疑的态度。他对着本应认识的健露出了诡异的表情，并表示“看来你们似乎是我的敌人”。这让健等人陷入了困惑和疑惑之中。
除此之外，还有一个神秘人物一直在暗中监视着他们的行动。这个人名叫“神鹰乔”，曾经与健一起并肩对抗恶魔党，如今却成为了科学忍者队的No.2。
四位英雄将如何应对这个未知的世界和他们身后的谜团？全新的激战将在银幕上展开，让我们一同见证这场壮丽的冒险！这部电影充满了令人惊喜的剧情和刺激的战斗，绝对不容错过！
